Program Magister Pendidikan Sains Universitas Negeri Yogyakarta (UNY) telah terakreditasi oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) dengan predikat unggul. Hal ini menunjukkan bahwa program studi ini telah memenuhi standar mutu nasional dalam penyelenggaraan pendidikan tinggi, termasuk dalam aspek kurikulum, sumber daya manusia, sarana prasarana, dan capaian lulusan. Predikat ini mencerminkan komitmen UNY dalam memberikan layanan pendidikan berkualitas dan mempersiapkan lulusan yang kompeten di bidang pendidikan sains. Informasi lebih lanjut tentang akreditasi program ini dapat diakses melalui dokumen resmi (SK dan Sertifikat) dapat diunduh pada file yang dilampirkan.